常用计算机辅助药物设计软件教程 pdf下载

计算机辅助药物设计已成为一门新兴的研究领域，在合理药物设计中发挥不可或缺的作用。张亮仁编著的《常用计算机辅助药物设计软件教程》依据实际工作中各种软件的应用，介绍了分子动力学模拟、分子对接、蛋白质同源模建、定量构效关系的研究、药效团的构建、虚拟筛选等内容，且每一内容有不止一个软件的使用介绍，适合入门计算机辅助药物设计的广大师生参考使用。


第#一章同源模建法预测蛋白质结构
第#一节同源模建概述
第二节同源模建
第二章分子对接预测结合位点
第#一节利用AutoDock进行分子对接
第二节利用D0CK进行分子对接
第三节利用Surflex-Dock进行分子对接
第四节利用GOLD进行分子对接
第三章蛋白质与核酸的分子动力学模拟
第#一节分子动力学概述
第二节利用GROMACS进行纯蛋白分子动力学模拟
第三节蛋白与小分子复合物的动力学模拟
第四节核酸分子动力学模拟
第四章利用OpenEye组件包进行虚拟筛选
第#一节软件简介
第二节利用OpenEye组件包进行虚拟筛选
第五章定量构效关系分析
第#一节CoMFA&CoMSIA
第二节HQsAR
第六章药效团
第#一节药效团介绍
第二节利用Discovery Studio进行药效团模型构建
第七章全新药物设计
第#一节概述
第二节利用LigBuilder进行全新药物设计
第八章作图软件PyMOL的应用
第#一节PyMOL简介
第二节PyMOL基本操作
第九章药物设计实例
第#一节利用OpenEye发现F.tularensis烯酰基载体蛋白还原酶FabI抑制剂
第二节基于模建结构的虚拟筛选发现对虾黄头病毒蛋白酶抑制剂
第三节基于药效团建模和分子对接的虚拟筛选发现β-分泌酶抑制剂
参考文献
彩图